L'une des causes les plus fréquentes de thyroïdite auto-immune est la carence en iode associée à une carence en sélénium. Au départ, de nombreux médecins ont refusé de donner de l'iode aux patients atteints d'AIT, craignant la croissance d'anticorps et l'aggravation du processus inflammatoire. Aujourd'hui, on sait que ce problème n'est rien de plus qu'un mythe propagé par des médecins qui utilisaient un protocole de charge en iode incomplet ou en donnaient à petites doses de l'ordre de 200 à 400 mcg par jour. Les études modernes de différents pays étudiant la relation entre l'apport en iode et la croissance des anticorps le réfutent unanimement.
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